Upacara bendera rutin dilaksanakan setiap hari Senin diikuti oleh seluruh siswa, guru, dan staf SMPN 5 Sumbermanjing Wetan Satu Atap. Selain sebagai wujud kedisiplinan, kegiatan ini juga menjadi sarana penguatan nilai-nilai Profil Pelajar Pancasila kepada peserta didik.